Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E3

ZNFX1, NFX1-type zinc finger-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNFX1Q9P2E3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNFX1Q9P2E3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNFX1Q9P2E3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNFX1Q9P2E3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNFX1Q9P2E3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNFX1Q9P2E3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNFX1Q9P2E3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNFX1Q9P2E3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNFX1Q9P2E3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNFX1Q9P2E3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNFX1Q9P2E3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNFX1Q9P2E3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNFX1Q9P2E3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNFX1Q9P2E3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
ZNFX1Q9P2E3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ZNFX1Q9P2E3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ZNFX1Q9P2E3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNFX1Q9P2E3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNFX1Q9P2E3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNFX1Q9P2E3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms