Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1F3

ABRACL, Costars family protein ABRACL, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRACLQ9P1F3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ABRACLQ9P1F3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABRACLQ9P1F3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms