Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCNT4Q9P109 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCNT4Q9P109 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms