Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HMG20BQ9P0W2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HMG20BQ9P0W2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HMG20BQ9P0W2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HMG20BQ9P0W2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HMG20BQ9P0W2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HMG20BQ9P0W2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HMG20BQ9P0W2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms