Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXXC1Q9P0U4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms