Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM5

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP53Q9NZM5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOP53Q9NZM5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOP53Q9NZM5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOP53Q9NZM5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOP53Q9NZM5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOP53Q9NZM5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOP53Q9NZM5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NOP53Q9NZM5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOP53Q9NZM5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOP53Q9NZM5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOP53Q9NZM5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOP53Q9NZM5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOP53Q9NZM5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOP53Q9NZM5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOP53Q9NZM5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOP53Q9NZM5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOP53Q9NZM5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms