Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYC9

DNAH9, Dynein heavy chain 9, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 4,486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAH9Q9NYC9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
DNAH9Q9NYC9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAH9Q9NYC9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms