Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLCO1C1Q9NYB5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms