Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDND1Q9NY35 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms