Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC3

SLC38A7, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A7Q9NVC3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC38A7Q9NVC3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms