Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCF3Q9NUQ8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.8 ms