Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUJ3

TCP11L1, T-complex protein 11-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L1Q9NUJ3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TCP11L1Q9NUJ3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms