Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms