Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms