Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms