Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNGB3Q9NQW8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNGB3Q9NQW8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNGB3Q9NQW8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNGB3Q9NQW8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNGB3Q9NQW8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNGB3Q9NQW8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNGB3Q9NQW8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNGB3Q9NQW8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNGB3Q9NQW8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNGB3Q9NQW8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNGB3Q9NQW8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNGB3Q9NQW8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNGB3Q9NQW8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNGB3Q9NQW8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNGB3Q9NQW8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNGB3Q9NQW8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNGB3Q9NQW8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CNGB3Q9NQW8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNGB3Q9NQW8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNGB3Q9NQW8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGB3Q9NQW8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGB3Q9NQW8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGB3Q9NQW8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGB3Q9NQW8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGB3Q9NQW8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGB3Q9NQW8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGB3Q9NQW8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGB3Q9NQW8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGB3Q9NQW8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNGB3Q9NQW8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
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