Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT4

EXOSC5, Exosome complex component RRP46, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC5Q9NQT4 STAG2-211ENST00000455404 2089 ntTSL 58.99□□□□□ -0.971e-6■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 CNIH1-207ENST00000557690 838 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.024e-7■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 CNIH1-202ENST00000395573 1233 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.024e-7■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 CNIH1-204ENST00000554683 787 ntTSL 38.67□□□□□ -1.024e-7■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 STAG2-218ENST00000483575 864 ntTSL 58.47□□□□□ -1.051e-6■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 CNIH1-203ENST00000553660 785 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.064e-7■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 ACBD6-204ENST00000475338 964 ntTSL 58.27□□□□□ -1.091e-6■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.231e-6■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 STAG2-209ENST00000435103 742 ntTSL 55.82□□□□□ -1.481e-6■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 MIR4527HG-202ENST00000598649 329 ntTSL 35.71□□□□□ -1.51e-6■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.524e-7■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.544e-7■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.541e-6■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 ACBD6-205ENST00000496993 672 ntTSL 55.38□□□□□ -1.551e-6■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 STAG2-216ENST00000471107 709 ntTSL 55.29□□□□□ -1.561e-6■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 STAG2-214ENST00000466748 873 ntTSL 54.9□□□□□ -1.631e-6■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.71e-6■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 STAG2-206ENST00000394477 385 ntTSL 54.43□□□□□ -1.71e-6■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.731e-6■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.741e-6■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 STAG2-207ENST00000394478 676 ntTSL 53.81□□□□□ -1.81e-6■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 STAG2-210ENST00000435215 798 ntTSL 53.76□□□□□ -1.811e-6■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 STAG2-208ENST00000428941 678 ntTSL 33.51□□□□□ -1.851e-6■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 FAM210A-207ENST00000592976 1091 ntTSL 320.46■□□□□ 0.871e-7■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 FAM210A-204ENST00000588475 1389 ntTSL 319.97■□□□□ 0.791e-7■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 FAM210A-203ENST00000585785 1095 ntTSL 1 (best)19.34■□□□□ 0.691e-7■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 FAM210A-206ENST00000591269 1038 ntTSL 516.64■□□□□ 0.251e-7■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.041e-7■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 WDR27-206ENST00000474018 951 ntTSL 213.84□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.231e-7■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 WDR27-212ENST00000546953 3175 ntTSL 29.23□□□□□ -0.932e-6■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.196e-7■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 ZNF562-203ENST00000585350 577 ntTSL 511.98□□□□□ -0.495e-7■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 ZNF562-208ENST00000590155 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.315e-7■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.415e-7■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 ZNF562-206ENST00000588653 585 ntTSL 26.14□□□□□ -1.435e-7■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 ZNF562-207ENST00000589542 491 ntTSL 35.92□□□□□ -1.465e-7■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.675e-7■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 ZNF562-204ENST00000585688 1475 ntTSL 24.3□□□□□ -1.725e-7■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.875e-7■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 NLRP1-205ENST00000544378 5281 ntTSL 212.31□□□□□ -0.447e-7■■■■■ 30.1
EXOSC5Q9NQT4 NLRP1-202ENST00000269280 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.637e-7■■■■■ 30.1
EXOSC5Q9NQT4 NLRP1-208ENST00000571451 5444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.677e-7■■■■■ 30.1
EXOSC5Q9NQT4 NLRP1-201ENST00000262467 5131 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.767e-7■■■■■ 30.1
EXOSC5Q9NQT4 NLRP1-215ENST00000613500 4494 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.947e-7■■■■■ 30.1
EXOSC5Q9NQT4 NLRP1-216ENST00000617618 4788 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.977e-7■■■■■ 30.1
EXOSC5Q9NQT4 NLRP1-203ENST00000345221 4656 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.977e-7■■■■■ 30.1
EXOSC5Q9NQT4 NLRP1-217ENST00000619223 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.977e-7■■■■■ 30.1
EXOSC5Q9NQT4 NLRP1-214ENST00000577119 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.027e-7■■■■■ 30.1
EXOSC5Q9NQT4 NLRP1-210ENST00000572272 4422 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.067e-7■■■■■ 30.1
EXOSC5Q9NQT4 NLRP1-207ENST00000571307 4050 ntTSL 1 (best)8.24□□□□□ -1.097e-7■■■■■ 30.1
EXOSC5Q9NQT4 NLRP1-204ENST00000354411 4332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.097e-7■■■■■ 30.1
EXOSC5Q9NQT4 TMLHE-201ENST00000334398 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.87e-7■■■■■ 30.1
EXOSC5Q9NQT4 TMLHE-205ENST00000474677 298 ntTSL 34.28□□□□□ -1.727e-7■■■■■ 30.1
EXOSC5Q9NQT4 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.747e-7■■■■■ 30.1
EXOSC5Q9NQT4 DCAF6-212ENST00000491067 536 ntTSL 34.09□□□□□ -1.751e-8■■■■■ 30.1
EXOSC5Q9NQT4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.342e-8■■■■■ 30
EXOSC5Q9NQT4 CYB5R4-202ENST00000369681 9252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.852e-8■■■■■ 30
EXOSC5Q9NQT4 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 30
EXOSC5Q9NQT4 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.571e-6■■■■■ 30
EXOSC5Q9NQT4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.289e-7■■■■■ 30
EXOSC5Q9NQT4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.219e-7■■■■■ 30
EXOSC5Q9NQT4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.189e-7■■■■■ 30
EXOSC5Q9NQT4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.169e-7■■■■■ 30
EXOSC5Q9NQT4 RAB28-205ENST00000508274 1551 ntTSL 1 (best)11.02□□□□□ -0.659e-7■■■■■ 30
EXOSC5Q9NQT4 RAB28-207ENST00000511649 715 ntTSL 54.9□□□□□ -1.639e-7■■■■■ 30
EXOSC5Q9NQT4 HERC2-207ENST00000564734 3121 ntTSL 1 (best)13.42□□□□□ -0.266e-7■■■■■ 30
EXOSC5Q9NQT4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 30
EXOSC5Q9NQT4 TXNDC16-202ENST00000554399 504 ntTSL 413.18□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 30
EXOSC5Q9NQT4 ANKFY1-203ENST00000570934 1881 ntTSL 512.37□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 30
EXOSC5Q9NQT4 TXNDC16-201ENST00000281741 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.762e-7■■■■■ 30
EXOSC5Q9NQT4 ANKFY1-209ENST00000574367 5033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.12e-6■■■■■ 30
EXOSC5Q9NQT4 ANKFY1-201ENST00000341657 7418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.22e-6■■■■■ 30
EXOSC5Q9NQT4 ANKFY1-205ENST00000572412 3352 ntTSL 26.03□□□□□ -1.442e-6■■■■■ 30
EXOSC5Q9NQT4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.632e-7■■■■■ 29.9
EXOSC5Q9NQT4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.542e-7■■■■■ 29.9
EXOSC5Q9NQT4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.052e-7■■■■■ 29.9
EXOSC5Q9NQT4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 29.9
EXOSC5Q9NQT4 YY1AP1-207ENST00000361140 2701 ntTSL 1 (best)13.86□□□□□ -0.192e-7■■■■■ 29.9
EXOSC5Q9NQT4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.242e-7■■■■■ 29.9
EXOSC5Q9NQT4 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 29.9
EXOSC5Q9NQT4 YY1AP1-218ENST00000454523 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 213.33□□□□□ -0.282e-7■■■■■ 29.9
EXOSC5Q9NQT4 YY1AP1-217ENST00000443231 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 312.69□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 29.9
EXOSC5Q9NQT4 YY1AP1-221ENST00000476093 1037 ntTSL 312.67□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 29.9
EXOSC5Q9NQT4 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.472e-7■■■■■ 29.9
EXOSC5Q9NQT4 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.542e-7■■■■■ 29.9
EXOSC5Q9NQT4 YY1AP1-220ENST00000476027 927 ntTSL 311.2□□□□□ -0.622e-7■■■■■ 29.9
EXOSC5Q9NQT4 YY1AP1-209ENST00000368330 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.842e-7■■■■■ 29.9
EXOSC5Q9NQT4 YY1AP1-204ENST00000354691 2498 ntTSL 29.06□□□□□ -0.962e-7■■■■■ 29.9
EXOSC5Q9NQT4 YY1AP1-215ENST00000436865 2684 ntTSL 1 (best)7.76□□□□□ -1.172e-7■■■■■ 29.9
EXOSC5Q9NQT4 YY1AP1-203ENST00000347088 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.242e-7■■■■■ 29.9
EXOSC5Q9NQT4 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 29.9
EXOSC5Q9NQT4 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 29.9
EXOSC5Q9NQT4 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 29.9
EXOSC5Q9NQT4 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 29.9
EXOSC5Q9NQT4 DMXL2-201ENST00000251076 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.798e-7■■■■■ 29.9
EXOSC5Q9NQT4 ANO10-201ENST00000292246 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.012e-6■■■■■ 29.9
EXOSC5Q9NQT4 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.728e-7■■■■■ 29.9
EXOSC5Q9NQT4 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.818e-7■■■■■ 29.9
EXOSC5Q9NQT4 BNIP3-204ENST00000633835 1062 ntTSL 316.25■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 29.8
Retrieved 100 of 8,799 protein–RNA pairs in 62.5 ms