Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ50

MRPL40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL40Q9NQ50 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MRPL40Q9NQ50 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms