Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms