Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI0

TMEM138, Transmembrane protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM138Q9NPI0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms