Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP94

SLC39A2, Zinc transporter ZIP2, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A2Q9NP94 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC39A2Q9NP94 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC39A2Q9NP94 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms