Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNPLA8Q9NP80 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms