Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMURF1Q9HCE7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms