Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC97

GPR35, G-protein coupled receptor 35, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR35Q9HC97 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GPR35Q9HC97 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR35Q9HC97 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms