Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC4Q9HBW1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms