Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBF4

ZFYVE1, Zinc finger FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE1Q9HBF4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZFYVE1Q9HBF4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms