Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAV7

GRPEL1, GrpE protein homolog 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRPEL1Q9HAV7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GRPEL1Q9HAV7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRPEL1Q9HAV7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms