Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAD4

WDR41, WD repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR41Q9HAD4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR41Q9HAD4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
WDR41Q9HAD4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR41Q9HAD4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR41Q9HAD4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR41Q9HAD4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR41Q9HAD4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR41Q9HAD4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR41Q9HAD4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms