Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y2

RPF1, Ribosome production factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF1Q9H9Y2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPF1Q9H9Y2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPF1Q9H9Y2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPF1Q9H9Y2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPF1Q9H9Y2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPF1Q9H9Y2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RPF1Q9H9Y2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RPF1Q9H9Y2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPF1Q9H9Y2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPF1Q9H9Y2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPF1Q9H9Y2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPF1Q9H9Y2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPF1Q9H9Y2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPF1Q9H9Y2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPF1Q9H9Y2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPF1Q9H9Y2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPF1Q9H9Y2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPF1Q9H9Y2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPF1Q9H9Y2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPF1Q9H9Y2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPF1Q9H9Y2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPF1Q9H9Y2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPF1Q9H9Y2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPF1Q9H9Y2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPF1Q9H9Y2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPF1Q9H9Y2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPF1Q9H9Y2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPF1Q9H9Y2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPF1Q9H9Y2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPF1Q9H9Y2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPF1Q9H9Y2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RPF1Q9H9Y2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPF1Q9H9Y2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPF1Q9H9Y2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPF1Q9H9Y2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPF1Q9H9Y2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPF1Q9H9Y2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPF1Q9H9Y2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RPF1Q9H9Y2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPF1Q9H9Y2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPF1Q9H9Y2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RPF1Q9H9Y2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPF1Q9H9Y2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPF1Q9H9Y2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPF1Q9H9Y2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPF1Q9H9Y2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPF1Q9H9Y2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPF1Q9H9Y2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPF1Q9H9Y2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPF1Q9H9Y2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPF1Q9H9Y2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms