Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
C11orf49Q9H6J7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms