Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D3

XKR8, XK-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR8Q9H6D3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XKR8Q9H6D3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms