Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRN3Q9H3W5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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