Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC8Q9H0W5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC8Q9H0W5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms