Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ6

CHRNA10, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-10, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA10Q9GZZ6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA10Q9GZZ6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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