Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC90BQ9GZT6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms