Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDGFDQ9GZP0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDGFDQ9GZP0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDGFDQ9GZP0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDGFDQ9GZP0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDGFDQ9GZP0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDGFDQ9GZP0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDGFDQ9GZP0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDGFDQ9GZP0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDGFDQ9GZP0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PDGFDQ9GZP0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDGFDQ9GZP0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDGFDQ9GZP0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PDGFDQ9GZP0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDGFDQ9GZP0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDGFDQ9GZP0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDGFDQ9GZP0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDGFDQ9GZP0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDGFDQ9GZP0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDGFDQ9GZP0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDGFDQ9GZP0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDGFDQ9GZP0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDGFDQ9GZP0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDGFDQ9GZP0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDGFDQ9GZP0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDGFDQ9GZP0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDGFDQ9GZP0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDGFDQ9GZP0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PDGFDQ9GZP0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDGFDQ9GZP0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PDGFDQ9GZP0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDGFDQ9GZP0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDGFDQ9GZP0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PDGFDQ9GZP0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDGFDQ9GZP0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDGFDQ9GZP0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDGFDQ9GZP0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDGFDQ9GZP0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDGFDQ9GZP0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDGFDQ9GZP0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PDGFDQ9GZP0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDGFDQ9GZP0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDGFDQ9GZP0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDGFDQ9GZP0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PDGFDQ9GZP0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
PDGFDQ9GZP0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDGFDQ9GZP0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms