Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms