Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.7 ms