Protein–RNA interactions for Protein: Q9C004

SPRY4, Protein sprouty homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY4Q9C004 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPRY4Q9C004 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SPRY4Q9C004 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPRY4Q9C004 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPRY4Q9C004 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms