Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZD4

NUF2, Kinetochore protein Nuf2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUF2Q9BZD4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUF2Q9BZD4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms