Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM54Q9BYV2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms