Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU1

PBX4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX4Q9BYU1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PBX4Q9BYU1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBX4Q9BYU1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBX4Q9BYU1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBX4Q9BYU1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PBX4Q9BYU1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBX4Q9BYU1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBX4Q9BYU1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBX4Q9BYU1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBX4Q9BYU1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBX4Q9BYU1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBX4Q9BYU1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PBX4Q9BYU1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBX4Q9BYU1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBX4Q9BYU1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBX4Q9BYU1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBX4Q9BYU1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBX4Q9BYU1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBX4Q9BYU1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBX4Q9BYU1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBX4Q9BYU1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBX4Q9BYU1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBX4Q9BYU1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBX4Q9BYU1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBX4Q9BYU1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBX4Q9BYU1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBX4Q9BYU1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBX4Q9BYU1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBX4Q9BYU1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PBX4Q9BYU1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PBX4Q9BYU1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PBX4Q9BYU1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PBX4Q9BYU1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PBX4Q9BYU1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PBX4Q9BYU1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PBX4Q9BYU1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PBX4Q9BYU1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PBX4Q9BYU1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PBX4Q9BYU1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PBX4Q9BYU1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PBX4Q9BYU1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PBX4Q9BYU1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms