Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR8

KRTAP3-1, Keratin-associated protein 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-1Q9BYR8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms