Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
PCGF6Q9BYE7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PCGF6Q9BYE7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PCGF6Q9BYE7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PCGF6Q9BYE7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PCGF6Q9BYE7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PCGF6Q9BYE7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PCGF6Q9BYE7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PCGF6Q9BYE7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PCGF6Q9BYE7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PCGF6Q9BYE7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PCGF6Q9BYE7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PCGF6Q9BYE7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PCGF6Q9BYE7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
PCGF6Q9BYE7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PCGF6Q9BYE7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PCGF6Q9BYE7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PCGF6Q9BYE7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PCGF6Q9BYE7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PCGF6Q9BYE7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PCGF6Q9BYE7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PCGF6Q9BYE7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PCGF6Q9BYE7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PCGF6Q9BYE7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PCGF6Q9BYE7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PCGF6Q9BYE7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PCGF6Q9BYE7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PCGF6Q9BYE7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PCGF6Q9BYE7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PCGF6Q9BYE7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PCGF6Q9BYE7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PCGF6Q9BYE7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PCGF6Q9BYE7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PCGF6Q9BYE7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PCGF6Q9BYE7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
PCGF6Q9BYE7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
PCGF6Q9BYE7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
PCGF6Q9BYE7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PCGF6Q9BYE7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PCGF6Q9BYE7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PCGF6Q9BYE7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PCGF6Q9BYE7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms