Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC8Q9BY41 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms