Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG8

KIFC3, Kinesin-like protein KIFC3, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC3Q9BVG8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIFC3Q9BVG8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIFC3Q9BVG8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIFC3Q9BVG8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIFC3Q9BVG8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIFC3Q9BVG8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIFC3Q9BVG8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIFC3Q9BVG8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIFC3Q9BVG8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIFC3Q9BVG8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KIFC3Q9BVG8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIFC3Q9BVG8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms