Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms