Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDC1Q9BTX1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDC1Q9BTX1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms