Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms