Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms